MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 108585

< Previous12...206207208209210211212213214215216217218Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
108501	NC_019738	GAA	2	6	7458825	7458830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314400
108502	NC_019738	GAA	2	6	7458844	7458849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314400
108503	NC_019738	TGC	2	6	7458863	7458868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314400
108504	NC_019738	GGAT	2	8	7459046	7459053	25 %	25 %	50 %	0 %	428314400
108505	NC_019738	AG	3	6	7459059	7459064	50 %	0 %	50 %	0 %	428314400
108506	NC_019738	GTG	2	6	7459157	7459162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314400
108507	NC_019738	TGGG	2	8	7459172	7459179	0 %	25 %	75 %	0 %	428314400
108508	NC_019738	TTG	2	6	7459199	7459204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314400
108509	NC_019738	TTGG	2	8	7459206	7459213	0 %	50 %	50 %	0 %	428314400
108510	NC_019738	GGC	2	6	7459284	7459289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314400
108511	NC_019738	AGA	2	6	7459359	7459364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314400
108512	NC_019738	GCC	2	6	7459442	7459447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314400
108513	NC_019738	TGA	2	6	7459494	7459499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314400
108514	NC_019738	CAA	2	6	7459540	7459545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314400
108515	NC_019738	CGA	2	6	7459593	7459598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314400
108516	NC_019738	TTA	2	6	7459663	7459668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314400
108517	NC_019738	ACA	2	6	7459781	7459786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314400
108518	NC_019738	TGG	2	6	7459796	7459801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314400
108519	NC_019738	GGC	2	6	7459833	7459838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314400
108520	NC_019738	ATA	2	6	7459841	7459846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314400
108521	NC_019738	TGAG	2	8	7460012	7460019	25 %	25 %	50 %	0 %	428314400
108522	NC_019738	GAT	2	6	7460034	7460039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314400
108523	NC_019738	GATGAC	2	12	7460332	7460343	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428314400
108524	NC_019738	T	6	6	7460344	7460349	0 %	100 %	0 %	0 %	428314400
108525	NC_019738	TCG	2	6	7460358	7460363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314400
108526	NC_019738	GAG	2	6	7460435	7460440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314400
108527	NC_019738	GAT	2	6	7460536	7460541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314400
108528	NC_019738	GAT	2	6	7460545	7460550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314400
108529	NC_019738	TAC	2	6	7460736	7460741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314401
108530	NC_019738	GAG	2	6	7460775	7460780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314401
108531	NC_019738	AAG	2	6	7460784	7460789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314401
108532	NC_019738	CGA	2	6	7460796	7460801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314401
108533	NC_019738	CAG	2	6	7460845	7460850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314401
108534	NC_019738	GAA	2	6	7460939	7460944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314401
108535	NC_019738	A	6	6	7460943	7460948	100 %	0 %	0 %	0 %	428314401
108536	NC_019738	CAA	2	6	7461167	7461172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314401
108537	NC_019738	G	6	6	7461288	7461293	0 %	0 %	100 %	0 %	428314401
108538	NC_019738	GA	4	8	7461295	7461302	50 %	0 %	50 %	0 %	428314401
108539	NC_019738	C	6	6	7461427	7461432	0 %	0 %	0 %	100 %	428314401
108540	NC_019738	TTCT	2	8	7461434	7461441	0 %	75 %	0 %	25 %	428314401
108541	NC_019738	AGTT	2	8	7461634	7461641	25 %	50 %	25 %	0 %	428314401
108542	NC_019738	AAGA	2	8	7461679	7461686	75 %	0 %	25 %	0 %	428314401
108543	NC_019738	GA	3	6	7461714	7461719	50 %	0 %	50 %	0 %	428314401
108544	NC_019738	ATT	2	6	7467460	7467465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314402
108545	NC_019738	AAAT	2	8	7467504	7467511	75 %	25 %	0 %	0 %	428314402
108546	NC_019738	TAAG	2	8	7467626	7467633	50 %	25 %	25 %	0 %	428314402
108547	NC_019738	ACA	2	6	7467642	7467647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314402
108548	NC_019738	AATC	2	8	7467809	7467816	50 %	25 %	0 %	25 %	428314402
108549	NC_019738	CAT	2	6	7467831	7467836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314402
108550	NC_019738	ATT	2	6	7467898	7467903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314402
108551	NC_019738	ATG	2	6	7467941	7467946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314402
108552	NC_019738	AGC	2	6	7468088	7468093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314402
108553	NC_019738	TGA	2	6	7468104	7468109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314402
108554	NC_019738	AGT	2	6	7468137	7468142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314402
108555	NC_019738	TTAT	2	8	7468220	7468227	25 %	75 %	0 %	0 %	428314402
108556	NC_019738	TAC	2	6	7468280	7468285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314402
108557	NC_019738	GT	3	6	7468344	7468349	0 %	50 %	50 %	0 %	428314402
108558	NC_019738	TAA	2	6	7468368	7468373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314402
108559	NC_019738	TGG	2	6	7468413	7468418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314402
108560	NC_019738	ATT	2	6	7468486	7468491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314402
108561	NC_019738	CGGG	2	8	7468549	7468556	0 %	0 %	75 %	25 %	428314402
108562	NC_019738	GGT	2	6	7468578	7468583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314402
108563	NC_019738	A	6	6	7468621	7468626	100 %	0 %	0 %	0 %	428314402
108564	NC_019738	TTA	2	6	7468666	7468671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314402
108565	NC_019738	GAA	2	6	7468732	7468737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314402
108566	NC_019738	TAA	2	6	7468839	7468844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314402
108567	NC_019738	TGAG	2	8	7469012	7469019	25 %	25 %	50 %	0 %	428314402
108568	NC_019738	T	6	6	7469101	7469106	0 %	100 %	0 %	0 %	428314402
108569	NC_019738	AGA	2	6	7469130	7469135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314402
108570	NC_019738	CTT	2	6	7469402	7469407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314403
108571	NC_019738	GTA	2	6	7469412	7469417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314403
108572	NC_019738	CTTG	2	8	7469452	7469459	0 %	50 %	25 %	25 %	428314403
108573	NC_019738	GTAAG	2	10	7469495	7469504	40 %	20 %	40 %	0 %	428314403
108574	NC_019738	TCT	2	6	7469509	7469514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314403
108575	NC_019738	CTT	2	6	7469621	7469626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314403
108576	NC_019738	GCA	2	6	7469714	7469719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314403
108577	NC_019738	TGT	2	6	7469747	7469752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314403
108578	NC_019738	GCT	2	6	7469888	7469893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314404
108579	NC_019738	CT	3	6	7469926	7469931	0 %	50 %	0 %	50 %	428314404
108580	NC_019738	GAT	2	6	7469960	7469965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314404
108581	NC_019738	ATC	2	6	7470154	7470159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314404
108582	NC_019738	ATAA	2	8	7470217	7470224	75 %	25 %	0 %	0 %	428314404
108583	NC_019738	TGC	2	6	7470249	7470254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314404
108584	NC_019738	GTT	2	6	7470305	7470310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314404
108585	NC_019738	TTG	2	6	7470348	7470353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314404

< Previous12...206207208209210211212213214215216217218Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.